因為一代的成功，SQUARE在一代發行後的一年很快地完成製作最终幻想II並將其推出市面。因為製作一代時沒有預想過會推出續集，所以製作人還是認為往後每集獨立發展為佳，也有更自由和較大的空間去發展。本作故事比第一代有著更緊密的設定，詳細設定了世界觀和幾個國家的關係，各角色的背景都有詳細的描述。
故事概要
帝國展開了對各國的入侵，主角菲利奧尼爾、瑪莉亞、蓋和萊恩哈特的鄉村都慘被破壞。他們在帝國騎士的追擊下被菲因王國的姬蕾妲公主救起來了。結果萊恩哈特在過程中行蹤不明，其餘三人則在公主所建立的反抗軍中奮戰對抗帝國，他們在過程中認識了不少戰友和英雄好漢，最後在眾人的幫助下終於打倒了帝國的皇帝。
原以為事情已告一段落，宿敵黑騎士卻接管了王位並操控帝國軍消滅反抗者，更令人驚訝的是黑騎士的真正身份就是失蹤多時的萊恩哈特，就在決戰一觸即發時，皇帝死而復生，並揚言要毀滅整個世界，萊恩哈特亦不得不放下個人野心與主角們共同對抗皇帝，並向地獄的大混亂城進發，與皇帝展開最終一戰。
另外，ＦＦ著名角色ＣＩＤ，陸行鳥，龍騎士也是在這代開始出現。而在往返的重製版官方更加入了在劇情戰死的角色們往後在天堂的故事，以之補完部分故事設定，結果大受好評。
沒有在北美推出英文版的原因
FF2 FF3均沒有在北美地區推出，導致FF4在北美區被名為FF2，原因除了是北美方面的經營問題外，另一主要問題是其英譯問題，受紅白機卡帶的容量限制影響，大量角色對白都無法傳神演譯，在一再推遲的情況下，遊戲界已經進入超級任天堂時代了，所以廠商方面索性跳過FF2 FF3，直接在北美地區推出FF4。
RPG史上最奇昇級方式
FF2大膽地採用了沒有等級設定的升級方式，角色們可通過各方面的使用量而提昇有關數值。例如：角色經常受傷，HP量會增加。／角色經常用魔法，有關魔法的能力都會增加。在這樣的制度下，雖然各角都設有不同的起始數值，但只要夠努力，任何人都可以變成樣樣都精的萬人敵，不旦讓角色變得毫無個性，更造就超級升級法的ＢＵＧ的出現！
所謂超級升級法就是利用系統記憶你使用技能和指令次數的特性，不停選擇指令，但在指定敵人時按取消去累積次數，這樣就能在初期一場普通戰鬥中將數值提昇到最強級。而昇血量和ＭＰ的方法也很簡單，就是讓角色們在戰鬥中互毆就可以了。(如撒雅人般自殘升級，夠神奇了吧?）
這樣致命的系統當然大受批評，但這個發想卻無擬擴闊了往後ＲＰＧ在育成和升級方面的概念。